Image J を使った細胞種類ごとの細胞数の手動カウント

Multi-point tool での手動セルカウントを、極めて簡潔に記載します。

1. 必要なら、画像の上を右クリックして、duplicate しましょう。
2. 必要に応じて Process > Sharpen で、シャープな画像にします。
3.  Plugins > Analyze > Grid で格子をかけます。青が好きです。
4. サンプルの状態によっては、虫めがねツールで拡大します。
5. ツールバーの左から7番目の5角形の星座のようなアイコンをダブルクリックします。これで、Multi-point tool 設定用のパネルが開きます。
• 画像に適した、Type と Size を選びましょう。
• Counter の数字は、細胞の種類と心得、選択しましょう
6. 数えたい種類一致の細胞を、せっせとクリックします
7. キーボードの "y" を押したら、細胞の種類とクリック した数を 、リアルタイムで表示するパネルが開きます。

しばらく、お試しになってから、本番にされることを薦めます。

Version 1.50c までの場合

1. ツールバーから Plugins > Analyze > Cell Counter を選択します。
2. Cell Counter のツールバー右上の Keep Original にチェックを入れ、元データを加工してしまわないように保護します。
3. Cell Counter のツールバー 右上2つ目の Initialize を押します。
4. 必要に応じて Process > Sharpen で、シャープな画像にします。
5.  Plugins > Analyze > Grid で格子をかけます.
6. サンプルの状態によっては、虫めがねツールで拡大します。
7. Cell Counter のツールバー左の Type を選んで、画像上の細胞をクリックすると、Type 毎に何回クリックしたかカウントしてくれ、細胞上に Type の番号をふってくれます。この際に、カーソルが、"+" になるツールを使って下さい。虫めがね、手の移動用ツールでは、カウントされません。
8. カウントが終了したら、File > Save As で、好みの画像形式で保存します。